Pedras Salgadas – Académica** – 1-0
Portalegrense* – Farense** – 0-3
Caçadores Taipas – Arouca** – 0-1
Alverca – Ac. Viseu** – 0-3
Águeda – Famalicão** – 1-0
Sacavenense – Varzim** – 2-1
Condeixa* – P. Ferreira** – 1-3
Cesarense – Covilhã** – 1-1 (1-2 a.p.)
Trofense – Penafiel** – 2-3
Leça – Leixões** – 0-3
Limianos – Mafra** – 2-1
Gondomar – Cova Piedade** – 1-2
Fátima – Oliveirense** – 1-0
Vasco Gama – Estoril** – 0-1
V. Sernache* – Sertanense – 1-3
U. Tomar* – Vilafranquense – 0-3
Vila Real* – Sanjoanense – 2-2 (2-2 a.p.) (5-4 g.p.)
Fafe – Sp. Ideal – 1-0
Caldas – Gafanha – 1-2
Vila Flor* – Amarante – 0-5
Beneditense* – Armacenenses – 0-3
Rio Tinto* – Moura – 1-4
Silves* – Paredes – 2-1
Santa Iria – Lourinhanense* – 3-1
Praia Mil Fontes* – Valenciano* – 2-5
Oliveira Hospital – Lusitano Vildemoinhos – 1-1 (1-1 a.p.) (3-5 g.p.)
Peniche – Montalegre – 1-3
Casa Pia – Montijo – 2-0
Anadia – Aljustrelense* – 3-1
Merelinense – União Madeira – 0-3
Eirense* – Torreense – 0-3
Lusitano Évora* – Oriental – 0-0 (1-3 a.p.)
Gil Vicente – Chaves (clube) – 0-1
Praiense – Pinhalnovense – 5-1
Vale Formoso* – U. Leiria – 0-3
G.R. Amigos Paz* – U. Santiago Cacém* – 2-4
Sp. Espinho – Sintrense – 0-0 (0-0 a.p.) (6-5 g.p.)
Torres Novas* – Maria da Fonte – 0-4
Beira-Mar* – São Martinho – 0-1
Silgueiros* – Angrense – 0-2
Real – Mirandela – 0-0 (0-0 a.p.) (4-5 g.p.)
Amora – Sp. Lamego* – 8-0
Mirandês – Coimbrões – 2-3
Felgueiras – Joane* – 2-0
Loures – Oleiros – 1-0
Valadares Gaia* – Louletano – 0-1
* Clubes dos Distritais
** Clubes da II Liga
Na eliminatória seguinte (1/32 final), os (18) participantes da I Liga juntar-se-ão aos (46) apurados desta 2.ª eliminatória (9 clubes da II Liga, 33 do Campeonato de Portugal e 4 dos Distritais – Vila Real, Silves, Valenciano e U. Santiago Cacém).
Por curiosidade, 9 das 22 equipas que haviam perdido na 1.ª eliminatória e que foram entretanto repescadas, avançam na prova: Coimbrões, Fátima, Louletano, Lusitano Vildemoinhos, Mirandês, Montalegre, U. Santiago Cacém, Valenciano e Vilafranquense.